Наиболее опасными и сложно устранимыми являются биологические чрезвычайные ситуации, в отличие от разовых аварий эти бедствия имеют свойство развиваться, захватывая все новые территории с невероятной скоростью. К биологическим ЧС относят эпидемии, эпифитотии и эпизоотии. Каждое из этих бедствий имеет свои специфические черты и способы устранения и профилактики.

Эпидемией именуют резкое увеличение заболевших людей, каким-либо инфекционным заболеванием, распространяющимся в скоростном режиме на все большие территории и приобретающее массовый характер. Характерной особенностью эпидемии является  скачек числа заболевших в сравнении с установившимся порогом.

Скачек заболевания и гибели животных и птиц, приобретающий массовый характер и значительно превышающий нормальный уровень в пределах территории называют эпизоотией.

И, наконец, эпифитотия представляет собой распространение заболевания дикорастущих и культурных растений: деревьев, трав, кустарников, превышающее установленные пределы в рамках определенной территории.

Развитие всех трех ситуаций происходит при условии наличия трех факторов: появление на территории возбудителя инфекции, присутствия в пределах распространения бедствия  объектов не способных бороться с возбудителем самостоятельно, а также путь передачи от зараженного объекта к здоровому. Режим чрезвычайной ситуации вводиться на всей пораженной  территории. Особенно важно в  процессе ликвидации биологического бедствия своевременно выявить точку (очаг) заражения и отрезать ее от сношений с внешним миром, для последующих мероприятий по устранению инфекции.

Общими в первых двух чрезвычайных ситуация являются следующие мероприятия:

- изолирование зараженных и проведение интенсивного их  лечения;

- обработка в санитарных целях всех животных и людей;

- проведение дезинфекции всех предметов на территории, пораженной инфекцией, в том числе предметов одежды и обуви, бытовые приборы, мебель, транспорт и прочее;

-  издание постановления о чрезвычайной ситуации и принятие мер ограничения въезда и выезда с такой территории, а также введение особого противоэпидемического порядка работы лечебных учреждений;

- введение строгих правил личной и общественной гигиены, это - мытье рук, употребление питьевой воды, обработанных продуктов в определенных  пищеблоках, контроль за утилизацией отходов зараженных, а также отграничения их контакта с внешним миром до обеззараживания;

- режим строго контроля состояния санитарии на производствах и предприятиях;

- активное информирование населения о правилах поведения в условиях чрезвычайной ситуации.

В отношении животных и растений может применяться также полная ликвидация зараженных объектов. Растения могут обрабатываться средствами химической защиты.